FFPE空间转录组揭秘肿瘤微环境的秘密,我的科研之旅(visium空间转录组)
大家好,我是来自中国科学院某研究所的研究员小王。今天,我想和大家分享我的科研故事,这个故事与FFPE空间转录组技术有关。
FFPE(Formalin-Fixed Paraffin-Embedded)空间转录组技术,是一种革命性的分子生物学技术,能够同时揭示组织中的空间结构和基因表达信息。在肿瘤研究领域,这项技术为我们提供了一个全新的视角,帮助我们深入了解肿瘤微环境。
我的研究始于2018年,当时我所在的研究团队正在进行一项关于肺癌的研究。在常规的基因表达分析中,我们发现了许多与肿瘤发生发展相关的基因,但这些基因在肿瘤组织中的空间分布情况却不得而知。
为了解决这个问题,我们尝试了FFPE空间转录组技术。这项技术通过结合空间转录组测序和空间信息分析,可以让我们在基因表达分析的了解基因在组织中的空间分布情况。
在实验过程中,我们首先对肺癌组织进行FFPE处理,然后进行切片,并利用空间转录组测序技术对每个细胞进行基因表达分析。通过分析这些数据,我们发现某些基因在肿瘤组织中的表达与肿瘤的恶性程度密切相关,并且这些基因的表达在肿瘤组织中的分布呈现出特定的空间模式。
例如,我们研究发现,与肿瘤侵袭相关的基因在肿瘤边缘区域的细胞中表达较高,而在肿瘤核心区域的细胞中表达较低。这一发现揭示了肿瘤侵袭的发生可能与肿瘤边缘区域细胞的基因表达异常有关。
通过FFPE空间转录组技术,我们不仅揭示了肿瘤微环境的秘密,还为肺癌的诊断和治疗提供了新的思路。以下是我对这项技术的几点
1. FFPE空间转录组技术能够同时揭示组织中的空间结构和基因表达信息,为研究肿瘤微环境提供了新的视角。
2. 该技术在肺癌等肿瘤研究中具有广泛的应用前景,可以帮助我们深入了解肿瘤的发生发展机制。
3. FFPE空间转录组技术与其他分子生物学技术相结合,可以进一步提高研究效率和准确性。
FFPE空间转录组技术为肿瘤研究带来了新的希望。我相信,在不久的将来,这项技术将为更多疾病的研究提供有力支持。我的科研之旅还在继续,期待与大家分享更多精彩的故事。