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空间转录组通量揭示微观世界,剧情深挖生命奥秘(空间转录组学 综述)
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宏基因组测序(二代)
宏基因组测序—环境微生物研究宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落 结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。应用方向人体或动物微生态及其与疾病关联:如肠道菌群,...
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三代宏基因组测序—超长读长,更真实地还原菌群及其功能组成三代宏基因组测序摆脱了二代读长短的限制,基于PacBio的超长读长,能轻松覆盖基因间区或基因特异性区域,更真实反馈菌群的复杂组成。除此之外,新三代测序技术-Nanopore 平台, 除了具有超长的读长之外,还以其更低的测序成本深受到研究者的关注,已成为宏基因组测序...
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16S、18S、ITS等扩增子测序(二代) 一步到位检测环境微生物多样性扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性...
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微生物重测序
微生物基因组重测序——一站式解析变异与差异微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。 微生物基因组重测序应运而生,它是基于小片段文库的高通量测序数据,通过与近缘参考基因组进行比对,从而进行变异检测的方法。 可以检测获得菌株和参考基因组的SNP、I...
细菌基因组草图
细菌基因组完成图(Pacbio/ONT)
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