常见问题
16S rDNA 扩增子测序:基于 Illumina HiSeq 双端测序的平台,选择某个或某几个变异区域,利用 保守区设计通用引物进行 PCR 扩增,然后对高变区进行测序 OTU(Operational Taxonomic Units)序列分 析和菌种鉴定。利用β多样性进行组间分析,找出在不同分类水平上的分组间丰度变化差异显著的物种。
非靶代谢组学:基于 LC-MS 色谱-质谱联用技术,尽可能多地对生物样本中的小分子代谢物进行定性 和相对定量分析。利用多维统计分析 OPLS-DA 的 VIP 值和单变量统计分析的 p 值找出分组间丰度变化差 异显著的代谢物。 关联分析:关联分析是数据深入挖掘的一种方式,主要用来发现隐藏在数据集中的关联性或相关性。
16S 与代谢的关联分析主要是基于统计学的算法来发现显著性差异的菌群与显著性差异的代谢物之间的 关联。