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技术速递
文献解读|Nat Commun(17.694):RNA 结合蛋白相互作用组的表征揭示了MYC扩增的髓母细胞瘤的特定背景转录后景观
文献解读|iScience(6.107):评估长期受辐射的腮腺中的转录景观和细胞间通讯
文献解读|Int J Oral Sci(24.897):全身性抗生素会增加微生物群的致病性和口腔骨质流失
文献解读|Bone Res(13.362):在单细胞水平表征肿瘤微环境揭示了骨肉瘤中一种新的免疫逃避机制
文献解读|Cell Rep(9.995):胃混合腺神经内分泌癌的精确显微解剖分析其基因组景观和进化克隆起源
文献解读|EBioMedicine(8.143):人类少突胶质瘤的免疫学特征定义了两种不同的分子亚型
文献解读|Nat Commun(17.694):单细胞RNA测序揭示化疗对人胰腺癌及其肿瘤微环境的影响
文献解读|Cell Rep(9.995):阴道上皮功能障碍由微生物组、代谢组和 mTOR 信号介导
文献解读|Nat Commun(14.919):胃印戒细胞癌的单细胞分析揭示了细胞学和免疫微环境特征
文献解读|(38.104):全基因组测序揭示HBV相关肝细胞癌早期复发的进化轨迹
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特色方案
10x 单细胞转录组
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具...
10x 单细胞ATAC
多数基因组中的染色质都紧紧盘绕在细胞核内,但也有一些区域经染色质重塑后呈现出松散的状态,这部分无核小体的裸露DNA区域被称为开放染色质(open chromatin),而DNA复制和基因转录都发生在这些区域。染色质的这种特性叫做染色质的易接近性(chromatin accessibility),通过研究细胞特定状态下开...
10x 单细胞VDJ
10x Genomics 单细胞及免疫组库测序 目前Chromium™单细胞V(D)J解决方案已升级,升级后的解决方案(Chromium Single Cell 5'Solution)一个样本可同时获得单细胞基因5'表达谱、T细胞受体和B细胞免疫球蛋白库的信息.可以结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复...
10x 单细胞多组学(scATAC+s
10x Visium FF 空间转录组
空间转录组测序 空间转录组是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,从而解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。 单细胞RNA测序或组织样本RNA测序,均无法为研究...
10x Visium FFPE空间转录组
10x Visium FFPE 空间转录组测序——无偏检测组织切片基因表达,还原表达基因位置信息10x Visium FFPE 空间转录组测序:10x Visium FFPE空间转录组产品以高分辨率来展示组织不同位置的基因表达信息,增加信息检测维度。该产品具有样本准备简单、分辨 率高、灵敏度高和无偏检测基因表达等特点。...
scRNA+空间转录组
是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称为深度...
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