常见问题
单细胞转录组在单细胞级的分辨率下解析各个细胞类型的转录特征,代谢组处于基因调控网络的下游,刻画中心法则的终端信息。代谢组验证各个基因通路的活性结果以及挖掘关键的代谢通路成分,为解析细胞代谢异质性提供多组学、多层次的见解。
单细胞转录组与代谢组的关联重点在于“差异”,差异基因与差异代谢物的联系可以更好辅助后续的数据挖掘。在肿瘤研究中,耐药和非耐药人群的细胞组成差异、基因表达差异和代谢差异可以更好形成关联,明晰细胞表达什么基因产生什么代谢物完成耐药反应。
1. 通过单细胞转录组测序找到特定细胞的关键代谢通路,通过代谢组学检测对特定细胞亚群相关代谢物变化做验证。
2. 通过代谢组学筛选候选标志物,在单细胞转录组中快速锁定关注的代谢通路、相关基因及相应细胞类型,从而缩小研究范围。
3. 探究不同细胞亚群对代谢谱的响应及代谢异质性,辅助细胞分群并在细胞层面阐明疾病机理。