常见问题
1.重测序与基于基因组的变异检测有何差异?
2.基于重测序和基于单拷贝基因的进化分析有何差异?
3.重测序分析如何保证变异信息的可靠性?
微生物基因组重测序——一站式解析变异与差异
微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。 微生物基因组重测序应运而生,它是基于小片段文库的高通量测序数据,通过与近缘参考基因组进行比对,从而进行变异检测的方法。 可以检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SVCNV等变异信息,以精准快捷为特点,系统全面的检测变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。应用方向
相比芯片检测或者外显子测序,基因组 DNA 重测序可以全面的挖掘基因序列差异和结构变异,在全基因组水平上扫描并检测与生物体重要性状相关的突变位点,具有重大的科研价值和产业价值。利用全基因组重测序有助于快速发现与细菌/真菌重要性状相关的遗传变异,如病原真菌的致病因子信息、食用/药用真菌的功能基因。除此之外,在对大规模样本的分析过程中,结合进化学研究,可以帮助获取细菌/真菌进化史、传播规律等信息。