常见问题
1. Input和IP样本之间的关系是什么?
- Input和IP属于两个样本,:在前期检测、建库、测序环节中都是平行进行的,但是分析中需要将两个样本的测序数据进行整合分析,得出最终的Peak结果,并进行后续分析。
2.Input是什么?有什么作用?
- DNA片段化后,在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照(不进行免疫沉淀过程)。Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样本DNA一起经过逆转交联、DNA纯化以及其他方法检测。通过后续数据分析,我们可以通过Input对照排除背景噪音(非特异性结合所造成的假阳性Peaks),验证染色质断裂的效果和整个实验中IP效果,所以Input对照是IP-seq实验必不可少的步骤。
ChIP-seq
ChIP-seq—DNA-蛋白质相互作用研究技术
结合染色质免疫共沉淀技术(ChIP)和高通量测序技术,对目的蛋白结合的 DNA 片段进行测序,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的 DNA 区段。全基因组范围:
获取全基因组范围特定目的蛋白与DNA的互作信息。抗体类型丰富:
具有多种商品化 ChIP级抗体,高效支持实验开展。
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