English#空间转录组研究，样本数量如何确定？——以我的亲身经历为例#（空间转录组要几个样本组成）
大家好，我是从事生物信息学研究的XXX，今天想和大家分享一下关于空间转录组研究中样本数量确定的小故事。
空间转录组学（Spatial transcriptomics）是近年来兴起的一种新兴技术，通过在组织切片上对细胞进行转录组测序，从而在空间尺度上解析细胞间的异质性。在开展空间转录组学研究时，样本数量的确定是一个关键问题。
**故事背景**：
去年，我参与了一项研究，旨在解析脑肿瘤中的细胞异质性。我们选择了10例脑肿瘤组织样本，分别进行了空间转录组测序。在样本数量确定方面，我们遇到了一些困惑。
**专业知识**：
1. **样本数量与统计功效**：样本数量是影响统计功效的重要因素。一般来说，样本数量越多，统计功效越高，结果越可靠。
2. **样本数量与细胞捕获率**：空间转录组测序需要捕获足够数量的细胞才能进行后续分析。细胞捕获率与样本数量和空间分辨率有关。
3. **样本数量与组织类型**：不同组织类型的样本数量需求可能有所不同。例如，脑组织样本可能需要更多的细胞捕获。
**我的经历**：
在确定样本数量时，我们综合考虑了以下因素：
1. **前期研究**：参考了同类研究中的样本数量，发现大多在5-10个样本之间。
2. **统计功效**：通过模拟分析，确定了在10个样本时，统计功效可以达到90%以上。
3. **细胞捕获率**：根据空间分辨率和脑组织样本的特点，预估每个样本可以捕获约1000个细胞。
综合以上因素，我们最终确定了10个样本的数量。在后续分析中，我们成功解析了脑肿瘤中的细胞异质性，并揭示了肿瘤微环境中的关键细胞类型。
**总结**：
空间转录组研究中样本数量的确定需要综合考虑多个因素，如统计功效、细胞捕获率和组织类型等。在实际操作中，可以参考同类研究、模拟分析和前期研究经验。希望我的经历能对大家有所帮助！
