English单细胞测序技术揭开微小RNA在单细胞层面的奥秘（单细胞测序用来干什么）
大家好，我是从事生物信息学研究的李明。最近，有很多朋友问我：“单细胞测序能测mirna吗？”今天，我就结合自己的研究经历，来为大家解答这个问题。
让我们来了解一下什么是mirna。mirna，即微小RNA，是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA分子。它们在基因表达调控中扮演着重要的角色，通过与mRNA结合，影响mRNA的稳定性和翻译效率，从而调控基因表达。
那么，单细胞测序技术是如何检测mirna的呢？这里，我想分享一个我自己的真实故事。
故事发生在2019年，当时我所在的实验室正在研究某种肿瘤细胞的微环境变化。为了探究肿瘤细胞与周围细胞之间的相互作用，我们采用了单细胞测序技术，对肿瘤细胞及其微环境中的细胞进行测序。
在测序过程中，我们使用了RNA测序技术，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞微小RNA测序（scmiRNA-seq）。其中，scmiRNA-seq就是用来检测单细胞中的mirna表达情况。
以下是具体操作步骤：
1. **单细胞分离**：我们需要从肿瘤组织中分离出单个细胞。这通常通过微流控技术或荧光激活细胞分选（FACS）等方法实现。
2. **RNA提取**：分离出的单个细胞需要提取其中的RNA。在提取过程中，我们需要注意避免RNA的降解和污染。
3. **cDNA合成**：提取到的RNA需要通过逆转录酶将其转录成cDNA。这一步是为了后续的测序反应做准备。
4. **文库构建**：将cDNA作为模板，通过PCR扩增和连接适配器等步骤构建成测序文库。
5. **测序**：将构建好的文库进行高通量测序，如Illumina平台。
6. **数据分析**：通过生物信息学方法对测序数据进行处理，包括质量控制、比对、定量和差异表达分析等。
在分析过程中，我们发现scmiRNA-seq可以有效地检测单细胞中的mirna表达情况。通过比较肿瘤细胞和正常细胞中的mirna表达差异，我们可以发现一些与肿瘤发生发展相关的mirna，从而为肿瘤的诊断和治疗提供新的靶点。
单细胞测序技术完全可以用来检测mirna。通过scmiRNA-seq，我们可以深入了解mirna在单细胞层面的表达和调控，为生物学研究和临床应用提供重要信息。
