从Mirna到转录组测序我的科研之旅(mrna测序和转录组测序)
在科研的道路上,每一次的突破都像是在黑暗中找到了一束光。我最近在研究中遇到了Mirna和转录组测序这两个关键词,它们不仅点亮了我对基因调控研究的兴趣,还让我对生命科学的复杂性有了更深的理解。
记得那是在我研究生二年级的时候,我加入了实验室的一个项目,研究细胞凋亡过程中的基因调控。当时,我们的目标是找出哪些MicroRNA(Mirna)在细胞凋亡中扮演了关键角色。
Mirna是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA分子,它们通过与靶mRNA的互补序列结合,调控基因表达。为了探究Mirna在细胞凋亡中的作用,我们采用了转录组测序技术。
转录组测序是一种高通量测序技术,可以全面分析细胞在特定条件下所有转录本的组成和表达水平。它包括RNA提取、文库构建和测序三个步骤。
我们从细胞中提取RNA,然后使用化学方法将其降解成小片段。接着,我们将这些小片段连接起来,构建成适合测序的文库。我们使用测序仪对文库进行测序,得到大量的序列数据。
在分析这些数据时,我们使用了生物信息学工具,如Bowtie2和STAR进行序列比对,然后用DESeq2进行差异表达分析。通过这些步骤,我们成功鉴定出在细胞凋亡过程中显著上调或下调的Mirna。
举个例子,我们发现在细胞凋亡过程中,Mirna-34a的表达显著上调。进一步的研究表明,Mirna-34a通过结合靶mRNA的3'UTR区域,抑制了Bcl-2家族蛋白Bcl-xL的表达,从而促进了细胞凋亡。
这个发现让我深刻体会到了Mirna在基因调控中的重要性。Mirna的调控机制不仅涉及单个基因的表达,还可能影响整个基因网络的活性。
通过这次研究,我也对转录组测序技术有了更深的认识。它的高通量和全面性使得我们能够快速、准确地分析复杂的基因表达模式,为研究基因调控提供了强大的工具。
从Mirna到转录组测序,我的科研之旅充满了挑战和乐趣。这不仅让我学到了专业知识,也让我对生命科学的研究充满了敬畏之心。