FFPE转录组测序如何从有限样本中挖掘宝贵基因信息?(转录组测序ngs)
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更新时间:2024-09-14
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大家好,我是一名热爱生物信息学的科研工作者。最近,我在研究 FFPE 转录组测序时,发现这项技术能够在有限样本中挖掘到宝贵的基因信息,为疾病研究提供了新的思路。下面,我想结合自己的真实故事,为大家详细介绍一下 FFPE 转录组测序的魅力。
一、什么是 FFPE 转录组测序?
FFPE(Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded)是指石蜡包埋组织样本。这种样本在临床应用中非常常见,因为它们可以保存较长时间,便于长期保存和共享。FFPE 转录组测序则是利用 FFPE 样本进行转录组分析的一种技术。
二、FFPE 转录组测序的优势
1. 样本丰富:FFPE 样本在临床研究中应用广泛,因此可以收集到大量的样本,为基因研究提供了丰富的数据资源。
2. 耗材节省:与新鲜组织样本相比,FFPE 样本更加节省耗材,降低了研究成本。
3. 信息挖掘:FFPE 转录组测序可以揭示样本中的基因表达变化,为疾病研究和药物开发提供线索。
三、我的真实故事
在研究过程中,我曾遇到一个 FFPE 样本,这是一份来自晚期癌症患者的样本。由于患者已经去世,我们无法获得新鲜组织样本。为了揭示患者的基因表达特征,我们决定尝试 FFPE 转录组测序。
经过 FFPE 转录组测序分析,我们发现患者样本中存在一些与癌症相关的基因表达异常。这些异常基因可能与患者的病情发展和治疗效果有关。在此基础上,我们进一步研究了这些基因的生物学功能,并提出了针对性的治疗方案。
FFPE 转录组测序技术在临床研究中具有广泛的应用前景。通过结合体系化的专业知识,我们可以从有限样本中挖掘到宝贵的基因信息,为疾病研究和治疗提供新的思路。希望我的故事能够帮助大家更好地了解 FFPE 转录组测序的魅力。