English单细胞测序技术中分群的定义与应用（单细胞测序 分群）
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更新时间：2024-09-07
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一、什么是分群？
分群是将一组数据中的对象根据其相似性进行分组的过程。在单细胞测序中，分群指的是将具有相似基因表达模式的细胞聚类在一起，形成不同的细胞群体。这些群体通常代表着不同的细胞类型或亚群。
二、分群的目的
1. 揭示细胞异质性：通过分群，我们可以将具有相似基因表达特征的细胞归为一类，从而更好地理解细胞群体的生物学特性。
2. 发现新的细胞亚群：在分群过程中，可能会发现一些未被发现的细胞亚群，这有助于我们更全面地了解细胞多样性。
3. 探索细胞命运决定：通过对不同细胞群体进行深入分析，可以揭示细胞命运决定过程中的关键基因和信号通路。
4. 疾病诊断和治疗：在癌症等疾病研究中，分群可以帮助识别具有相似基因表达特征的细胞亚群，为疾病诊断和治疗提供新的思路。
三、单细胞测序分群的步骤
1. 数据预处理：对原始测序数据进行质量控制和过滤，去除低质量数据。
2. 数据标准化：将不同细胞的数据进行标准化处理，消除样本间差异。
3. 高维降维：利用主成分分析（PCA）、t-SNE、UMAP等方法将高维基因表达数据降至二维或三维空间，便于可视化。
4. 分群算法：根据基因表达相似性，运用K-means、层次聚类、密度聚类等方法进行分群。
5. 分群验证：通过细胞标记、细胞形态等特征对分群结果进行验证。
6. 分群分析：对每个细胞群体进行深入分析，挖掘其生物学特性。
单细胞测序分群是解析细胞异质性的重要手段，通过定义分群，我们可以更好地理解细胞群体的生物学特性，为细胞命运决定、疾病发生机制等领域的研究提供有力支持。随着单细胞测序技术的不断发展，分群方法也在不断优化，为生物学研究提供了更多可能性。
