单细胞测序标本冰冻保存技术要点与实验流程(单细胞测序实验流程)
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更新时间:2024-09-16
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随着单细胞测序技术的快速发展,单细胞水平的基因组学、转录组学和蛋白质组学研究成为生命科学领域的前沿热点。单细胞标本的冰冻保存是保证后续实验数据质量的关键步骤。本文将介绍单细胞测序标本冰冻保存的技术要点和实验流程。
一、技术要点
1. 选择合适的冰冻剂:常用的冰冻剂有二甲基亚砜(DMSO)和乙二醇(EG)。DMSO对细胞毒性较小,但挥发性强,需在通风柜中操作;乙二醇对细胞毒性较大,但不易挥发。根据实验需求选择合适的冰冻剂。
2. 控制冰冻速度:慢速冰冻可以减少细胞损伤。常用的方法有室温缓慢加入冰冻剂、低温(-80℃)慢速冻结等。
3. 适当解冻:解冻速度过快会导致细胞损伤,过慢会导致冰晶对细胞的损伤。通常采用室温下缓慢解冻或37℃水浴快速解冻。
4. 选择合适的冻存管:冻存管应具有较好的密封性能,防止冰冻剂泄露。选择适宜的冻存管材料,如聚丙烯(PP)或聚酯(PET)等。
二、实验流程
1. 准备工作:准备冻存管、冰冻剂、移液枪、离心机等实验器材。
2. 标本制备:将单细胞悬液离心去除上清,加入适量冰冻剂,混匀后转移至冻存管。
3. 冻存:将冻存管置于低温冰箱(-80℃)中,缓慢冻结。冻结过程中避免剧烈摇晃。
4. 解冻:将冻存管从低温冰箱中取出,室温下缓慢解冻,或37℃水浴快速解冻。
5. 标本处理:解冻后,将单细胞悬液离心去除上清,加入适量裂解液,混匀后进行后续实验。
6. 实验检测:根据实验目的,对解冻后的单细胞标本进行测序、转录组学或蛋白质组学等分析。
单细胞测序标本的冰冻保存对于保证实验数据的准确性具有重要意义。通过掌握合适的冰冻剂、控制冰冻速度、适当解冻和选择合适的冻存管等要点,可以有效提高单细胞测序实验的成功率。