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技术速递
文献解读|Nat Commun(14.7):超急性 HIV-1 感染期间血浆蛋白质组的动态
文献解读|Cell(42.5):系统分析显示甜菜碱可作为老年保护的运动模拟物
文献解读|Cancer Cell(44.5):空间蛋白质转录组分析揭示了边缘性卵巢肿瘤的分子景观及其侵袭性进展
文献解读|Cell Rep Med(11.7):患者来源的类器官的代谢分析表明核苷酸合成是恶性横纹肌样瘤的代谢脆弱性
文献解读|Nat Commun(14.7):胶质瘤的蛋白质组学分析揭示了免疫和代谢驱动的亚型,这对抗核苷酸代谢治疗有重要意义
文献解读|Cell Rep Med(11.7):新生儿肠道微生物群:在早产儿脑病中的作用
文献解读|Nat Commun(14.7):免疫疗法可改善高级别浆液性卵巢癌的化疗反应
文献解读|Cell Rep Med(11.7):多模态分析揭示了区分 EBV 阳性和 EBV 阴性移植后淋巴增生性疾病的肿瘤和免疫特征
文献解读|Nat Commun(14.7):空间转录组学揭示三阴性乳腺癌中存在显著的异质性,具有潜在的临床意义
文献解读|Cancer Discov(33.3):前列腺癌异质性的生殖细胞和体细胞起源
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人基因组重测序
人重测序通过对人类不同个体或群体进行全基因组重测序,并在个体或群体水平上进行生物信息分析,获得全面的SNP/InDel/CNV/SV等变异信息,并识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区域内的结构变异。结合大量的公共数据库提供的数据,有利于更好地解释所得变异结构之间的关联和致病机理。 应用领域1. 已知候选位点筛选及验...
人全外显子测序
外显子组是一个物种基因组中所有外显子区域的总和。外显子组测序是指利用序列捕获技术对全基因组外显子区域DNA进行富集再进行高通量测序的方法。该方法能够获得指定外显子捕获平台探针设计区域及侧翼200bp序列的遗传信息,极大的提高了人类基因组中外显子区域的研究效率,显著降低了研究成本。主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的...
CRISPR screen 文库筛选分析
CRISPR Screen——高通量基因编辑手段CRISPR Screen检测:基于CRISPR/Cas9技术,设计成千上万个sgRNA,在全基因组范围内进行基因编辑实验,筛选出大量突变细胞,识别与特定表型相关 的基因,通过高通量测序技术,统计每一种sgRNA reads富集数,比较每一组sgRNA变化情况,并按照从大...
CRISPR/Cas9 基因编辑脱靶分析
全基因组de novo测序(二代/三代)
基因组de novo测序即从头测序,是不依赖于任何参考序列对某物种进行测序,通过生物信息学分析手段进行拼接、组装,从而获得该物种全基因序列图谱。随着测序技术的发展、测序成本的降低,完成各物种的全基因组序列图谱已成为必然趋势。一个物种基因组序列图谱的完成,将带动该物种一系列后续研究的开展。 应用领域1. 基因组surv...
全基因组survey
基因组Survey—全面了解物种基因组特征基因组Survey基于小片段文库的低深度测序数据,通过K-mer分析,从而有效的评估基因组大小、GC含量、杂合度以及重复序列含量等信息,是全面了解某一物种基因组特征的有效方法,为后续的全基因组 de novo 测序组装策略的制定提供理论依据。
泛基因组测序
泛基因组测序—探秘物种间潜在密码泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。其中,核心基因组由所有样本中都存在的序列组成,一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性; 非必须基因组由仅在单个样本或部分样本中存在的序列组成,一般与物种对特定环境的...
动植物基因组重测序
基因组重测序是在已知物种基因组的情况下进行测序。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行基因组重测序,可从群体或个体水平全面挖掘基因组序列差异。该方法能以较低的成本获得大量、准确的基因组信息,对动植物育种研究及人类疾病等方面具有重大的指导意义。 应用领域1. 个体基因组变异检测2. 突变体功能突变位点定位3. 群...
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