定性蛋白质组学
定性蛋白质组
利用双向电泳(2D)和聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分离蛋白质混合物,
收集目的蛋白质胶点和胶条,经胶内酶解后,利用质谱来确定样品中的蛋白质组成,
其基本原理是利用质谱仪得到二级质谱的离子峰分布来鉴定样品中的肽段,进而鉴定蛋白种类。
蛋白质相互作用鉴定
通过液质联用技术(LC-MS/MS)对IP、Co-IP、Pull-down等纯化样本中的蛋白混合物进行鉴定， 可同时鉴定目的蛋白及其相互作用蛋白,从而构建与目的蛋白的蛋白质相互作用谱。
蛋白质组全谱鉴定
蛋白质组全谱鉴定是指蛋白质组分分析,是以完整的组织、血液或体液等复杂样本为研究对象, 目的在于识别出样品中尽可能多的肽段和蛋白质。基于质谱技术的全谱分析, 可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。
修饰定性蛋白质组
通过SDS-PAGE和液质联用技术(LC-MS/MS)对IP所得蛋白上的修饰位点进行鉴定, 可以对目前所有已知的修饰类型及一些特殊的小分子药物在蛋白上的修饰位点进行鉴定。
技术参数
| 产品类型 | 仪器平台 | 项目周期 |
|---|
| 定性蛋白质组 | 焦点胶条鉴定 | Thermo Q ExactiveTM HF-X | 20个自然日 |
| 组织、溶液等蛋白鉴定 | 40个自然日 |
信息分析流程
基于质谱检测得到的Raw文件,进行对应数据库的搜索,然后基于数据库搜索的结果进行蛋白质鉴 定,同时进行肽段、蛋白和母离子质量容差分布分析,来评定质谱检测数据的质量。然后对鉴定到的 蛋白进行常见功能数据库注释,包括COG、GO和KEGG数据库。信息分析流程如下图:
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