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常见问题

Q1: 可以用简化基因组测序来做QTL-seq分析吗？

A：由于简化基因组技术（GBS/RAD）是对基因组上的酶切片段进行测序，数据量一般只有基因组的1~10%，有可能会降低QTL定位的精度。同时，也无法进一步筛查QTL区间内的突变信息。因此，我们建议用全基因组重测序来进行QTL-seq分析。

 

Q2: 群体进化分析，需要选择简化基因组测序还是全基因组重测序？

A：考虑到自然群体极快的LD衰减距离， 简化基因组的覆盖度显得有所不足，全基因组重测序是趋势。推荐样本的全基因组重测序深度要大于基因组的10x。

 

Q3: 怎么确定性状是质量性状还是数量性状？

A：根据统计子代个体的性状分离比进行判断。质量性状子代分离比例为3：1，主效基因控制的数量性状子代分离比例接近3：1。


动植物基因组重测序

基因组重测序是在已知物种基因组的情况下进行测序。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行基因组重测序，可从群体或个体水平全面挖掘基因组序列差异。该方法能以较低的成本获得大量、准确的基因组信息，对动植物育种研究及人类疾病等方面具有重大的指导意义。

 

应用领域

1. 个体基因组变异检测2. 突变体功能突变位点定位3. 群体遗传学分析4. 全基因关联分析

 

技术路线

 

分析内容

1. 标准分析：原始数据基本分析、序列比对、SNP检测等；2. 高级分析：InDel检测、CNV检测、SV检测等；3. 个性化分析：群体遗传学分析、GWAS分析等。

 

 

样品要求

样品类型：无降解或者轻微降解、无RNA污染的DNA样品；

样品需求量：≥1 μg；样品浓度：>20 ng/μL；样品纯度：OD260/280= 1.8~2.0。


  • 电话：400-178-8899
  • 邮箱：support@kaitaibio.com
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