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常见问题

  • 1.全转录组产品两种技术模式如何选择？

    • 全转录组有两种，一种为两库全转，即采用两种建库测序模式；一种为三库全转，即采用三种建库测序模式；主要区别在于环状RNA研究方式不同，一个是对环状RNA广谱研究，即对环状RNA表达情况初步研究； 二是对环状RNA单独富集建库测序，即可实现对环状RNA高深度研究，以及低表达环状RNA的鉴定和定量分析等。可以根据研究目的和需求决定选择不同的建库方式。

  • 2.lncRNA建库测序结果可以用于分析环状RNA吗？

    • 可以，长链非编码RNA建库模式采用去核糖体方式建库，对所获得的RNA进行打断测序，相当于获得全部RNA，即可以进行分析环状RNA表达情况，可应用于分析各物种环状RNA表达谱。


全转录组

全转录组测序—研究非编码RNA与mRNA间的靶向调控以及相互作用关系

全转录组高通量测序，采用去核糖体链特异性建库方法和小片段富集筛选建库方法，可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、信息分析及联合分析、ceRNA等，从而快速全面准确地获得与特定生物学过程 （例如发育、疾病等）所有RNA转录本数据信息，通过数据分析将生物调控机制研究延伸到“ 网、多层面”结合的立体模式，有助于相对全面解读生物学现象。

  • 1.两库全转录组测序：LncRNA-Seq + Small RNA

    （1）采用去核糖体链特异性建库模式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析；
    （2）采用富集小RNA片段建库方法，进行SE50测序，实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量，以及功能分析等；

  • 2.三库全转录组测序：LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA

    （1）采用去核糖体链特异性建库模式，进行PE150测序，实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析；
    （2）采用去除线性RNA，富集环状RNA建库方法，进行PE150测序，实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析；
    （3）采用富集小RNA片段建库方法，进行SE50测序，实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量，以及功能分析等； 
    以上两种模式，还可以实现互作网络分析，以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。

应用方向

  • 动物方向

    人、小鼠、斑马鱼等胚胎发育、性腺发育、肌肉发育和免疫调控生命过程研究。

  • 植物方向

    植物逆境响应、器官发育、生殖生长和病毒侵染等研究。

  • 癌症疾病方向

    肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等疾病发生与诊治研究。


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