全基因组甲基化测序

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全基因组甲基化测序

DNA甲基化是表观遗传调控的常见机制。启动子区域的高度甲基化可导致基因表达改变。甲基化多发生于胞嘧啶(cytosine, C)位置。在细胞和组织分化、疾病发生以及适应环境等过程中,甲基化状态可发生改变。高精确度全基因组甲基化修饰状态的分析,将为发育、育种、肿瘤标志物鉴定或药物靶标寻找等研究奠定基础。
全基因组甲基化测序结合了亚硫酸氢盐转化(bisulfite conversion)方法与新一代高通量测序技术,可在单碱基分辨率水平上高效地检测全基因组DNA甲基化状态。亚硫酸氢盐处理可以使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,PCR扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。对 PCR产物进行高通量测序,与参考序列比对,即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化。
优势:
高分辨率和准确度:单碱基分辨率精确检测每一个甲基化位点的状态。
高覆盖度:该技术可在全基因组水平上最大限度的获取完整的甲基化信息,精确绘制全基因组甲基化图谱。
应用范围广:适用于所有具有参考基因组的物种,适于进行开创性工作。



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